第193章 生化学 LV.2 二

  他在旁边写下了一个基於统计力学的配分函数公式，甚至顺手引入了自旋玻璃理论中的哈密顿量：

  h(σ)=-Σ j??σ?σ?

  “本质上，这就是一个寻找全局最优解的过程。只要我们能构建出这个能量函数 h(σ)，摺叠路径就是黎曼流形上的测地线问题。虽然计算量大，但在拓扑上是確定的。”徐辰放下笔，笑著补充了一句，“所以deepmind的alphafold之所以能成功，我觉得本质上不是因为它懂生物，而是因为它懂几何。”

  陈志华看著那个图，眼皮跳了一下。

  这解释……太標准了。

  而且那个配分函数，写得也太顺畅了，不愧是数学系出来的，对数学公式的掌握简直炉火纯青。

  “有点意思。”陈志华坐直了身体，收起了刚才的轻视，“那我们再聊聊基因调控。现在的研究热点是转录爆发，你怎么看？”

  “那个啊，”徐辰撇了撇嘴，忍不住吐槽道，“现在的很多模型都太粗糙了，还在用希尔方程这种確定性的东西去描述。微观层面的分子碰撞是隨机的，尤其是在低拷贝数的情况下，噪音才是主角。”

  “所以？”

  “所以得引入隨机微分方程。”徐辰手中的笔没停，“把主方程做个近似，用fokker-planck方程来描述概率密度的演化。只有这样，才能解释为什么同样的基因型，在不同细胞里会表达出完全不同的表型。这本质上就是生物系统中的『布朗运动』。”

  陈志华的瞳孔微微收缩。

  他看著侃侃而谈的徐辰，心里掀起了惊涛骇浪。

  如果说刚才的蛋白质摺叠还是课本上的知识，那现在的“转录爆发”和“隨机微分方程”，可是这几年系统生物学最前沿的爭论焦点！

  这小子……上个月来找我的时候，连质粒图谱都还得问师兄怎么看。

  怎么才这么短的时间，就能掌握这么多的知识点。